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http://bibliotecatede.uninove.br/handle/tede/3041
Registro completo de metadados
Campo DC | Valor | Idioma |
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dc.creator | Boukouvalas, Dimitria Theophanis | - |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/1736571840787772 | por |
dc.contributor.advisor1 | Araújo, Sidnei Alves de | - |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/2542529753132844 | por |
dc.contributor.referee1 | Araújo, Sidnei Alves de | - |
dc.contributor.referee1Lattes | http://lattes.cnpq.br/2542529753132844 | por |
dc.contributor.referee2 | Vieira, Tiago Figueiredo | - |
dc.contributor.referee2Lattes | http://lattes.cnpq.br/8601011832053651 | por |
dc.contributor.referee3 | Prates, Renato Araújo | - |
dc.contributor.referee3Lattes | http://lattes.cnpq.br/7664790931310514 | por |
dc.contributor.referee4 | Deana, Alessandro Melo | - |
dc.contributor.referee4Lattes | http://lattes.cnpq.br/3678668865183045 | por |
dc.date.accessioned | 2022-08-15T14:46:27Z | - |
dc.date.issued | 2019-02-05 | - |
dc.identifier.citation | Boukouvalas, Dimitria Theophanis. Abordagem de visão computacional para contagem de unidades formadoras de colônias de micro-organismos. 2019. 89 f. Dissertação( Programa de Pós-Graduação em Informática e Gestão do Conhecimento) - Universidade Nove de Julho, São Paulo. | por |
dc.identifier.uri | http://bibliotecatede.uninove.br/handle/tede/3041 | - |
dc.description.resumo | A quantificação de unidades formadoras de colônias (UFCs) preparadas conforme a técnica padrão de espalhamento é uma rotina diária de laboratório que requer uma grande quantidade de recursos materiais, humanos e de tempo, uma vez que é executada manualmente em placas de Petri contendo uma única diluição da amostra. Por outro lado, a SP-SDS (Single Plate Serial Dilution Spotting, em tradução livre para o português: Diluição Serial em Placa Única) é uma técnica amplamente utilizada que permite grande redução no uso de recursos materiais e tempo, pois utiliza diversas diluições de uma amostra numa mesma placa de Petri. Existem diferentes abordagens na literatura para a automação da quantificação de UFCs que são baseadas em imagens de placas de Petri preparadas pela técnica padrão, em que há baixa variação das características das UFCs e que são capturadas sob condições de ambiente controlado, o que não é a realidade dos laboratórios. Em vista disso, nesta pesquisa foi proposta uma abordagem de visão computacional para quantificação automática de UFCs em imagens de placas de Petri preparadas pela técnica SP-SDS e adquiridas sob condições reais de laboratório, a qual é composta por três etapas: extração das regiões de interesse (diluições na placa de Petri), contagem de UFCs isoladas por meio de descritores de forma baseados em região, e contagem de UFCs em aglomerados por meio de granulometria por correlação cruzada. Nos experimentos realizados constatou-se que a abordagem proposta permite a quantificação de UFCs com acurácia de 99,5%, precisão de 99,7%, sensibilidade de 99,2% e especificidade de 98,3%. Esses resultados foram superiores aos resultados das abordagens Granul e OpenCFU, com as quais a abordagem proposta foi comparada. Em adição, a partir da abordagem proposta concebeu-se um software de fácil utilização para quantificação de UFCs. | por |
dc.description.abstract | Quantification of colony forming units (CFU) on microbial cultures prepared according to the standard spread plate technique is a daily laboratory routine that requires a large amount of material, human and time resources, as it is performed manually in Petri dishes containing a single dilution of the sample. On the other hand, SP-SDS (Single Plate Serial Dilution Spotting) is a widely used technique that allows great reduction in the use of material resources and time, since it uses several dilutions of a sample in the same Petri dish. There are different approaches in the literature for automation of CFU quantification that are based on images of standard spread plate Petri dishes with low variation of CFU features and captured under controlled lighting conditions, which is not the actual situation of laboratories. In view of this, in this study, a computational vision approach was proposed for automated quantification of CFU in Petri dishes prepared by the SP-SDS technique and acquired under real laboratory conditions, which is composed of three steps: extraction of regions of interest (Petri dish dilutions), counting of isolated CFU by region-based shape descriptors, and counting of CFU in agglomerates by cross-correlation granulometry. In the experiments carried out, it was verified that the proposed approach allows the quantification of CFU with accuracy of 99.5%, precision of 99.7% sensitivity of 99.2% and specificity of 98.3%. These results were superior to the results of the Granul and OpenCFU approaches, with which the proposed approach was compared. In addition, a user-friendly software for the quantification of CFU was conceived from the proposed approach. | eng |
dc.description.provenance | Submitted by Nadir Basilio (nadirsb@uninove.br) on 2022-08-15T14:46:27Z No. of bitstreams: 1 Dimitria Theophanis Boukouvalas.pdf: 2249909 bytes, checksum: b63363560d68a5ec7916378350b308b1 (MD5) | eng |
dc.description.provenance | Made available in DSpace on 2022-08-15T14:46:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dimitria Theophanis Boukouvalas.pdf: 2249909 bytes, checksum: b63363560d68a5ec7916378350b308b1 (MD5) Previous issue date: 2019-02-05 | eng |
dc.format | application/pdf | * |
dc.language | por | por |
dc.publisher | Universidade Nove de Julho | por |
dc.publisher.department | Informática | por |
dc.publisher.country | Brasil | por |
dc.publisher.initials | UNINOVE | por |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Informática e Gestão do Conhecimento | por |
dc.rights | Acesso Aberto | por |
dc.subject | contagem de colônias | por |
dc.subject | diluição serial | por |
dc.subject | granulometria por correlação cruzada | por |
dc.subject | descritores de forma baseados em região | por |
dc.subject | segmentação | por |
dc.subject | colony count | eng |
dc.subject | serial dilution | eng |
dc.subject | cross-correlation granulometry | eng |
dc.subject | region-based shape descriptors | eng |
dc.subject | segmentation | eng |
dc.subject.cnpq | CIENCIA DA COMPUTACAO::SISTEMAS DE COMPUTACAO | por |
dc.title | Abordagem de visão computacional para contagem de unidades formadoras de colônias de micro-organismos | por |
dc.title.alternative | Computational vision approach for counting of microorganisms colony forming units | eng |
dc.type | Dissertação | por |
Aparece nas coleções: | Programa de Pós-Graduação em Informática e Gestão do Conhecimento |
Arquivos associados a este item:
Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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Dimitria Theophanis Boukouvalas.pdf | Dimitria Theophanis Boukouvalas | 2,2 MB | Adobe PDF | Baixar/Abrir Pré-Visualizar |
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